85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0501 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  34.55 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  40.91 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  40.91 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  40.91 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  40.91 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  40.91 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  40.91 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  40.91 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  40.91 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  33.66 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  37.84 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  32.67 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  36.27 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  36.27 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  32.08 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  36.17 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  36.96 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  35.56 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  35.56 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  35.56 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  29.93 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  36.96 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  31.28 
 
 		 294 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  30.61 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  35.87 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  41.94 
 
 		 175 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4766  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000649517  hitchhiker  0.00211864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  30.77 
 
 		 280 aa  51.6  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  38.27 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  43.04 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  31.82 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  38.27 
 
 		 158 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  35.78 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  37.04 
 
 		 147 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  36.25 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  37.04 
 
 		 156 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  37.04 
 
 		 156 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  43.04 
 
 		 163 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  30.53 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  30.53 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  30.91 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  41.54 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  30.53 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  31.65 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  33.04 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  33.04 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  35.8 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  33.04 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  30.91 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  40.51 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  28.76 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  34.29 
 
 		 155 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  33.64 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  33.75 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  35.35 
 
 		 179 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  35.2 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  56.76 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  31.48 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  35.61 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  32.23 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  38.33 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  33.64 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  38.33 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  31.48 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  29.29 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  27.21 
 
 		 179 aa  42  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  33.94 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>