102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2480 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  100 
 
 
177 aa  344  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  72.26 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  55.17 
 
 
168 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  55.75 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  69.09 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  40.56 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  40.56 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  40.56 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  40.56 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  40.56 
 
 
218 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  40.56 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  40.56 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  34 
 
 
204 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  33.67 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  45.1 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  46.75 
 
 
246 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  37.23 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  32.37 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  32.37 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  41.75 
 
 
216 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_003296  RS00385  putative glycin-rich transmembrane protein  45.25 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  55.91 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  37.24 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  36.9 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  36.9 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  31.16 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  45.63 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  46.55 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  42.74 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4697  17 kDa surface antigen  42.53 
 
 
236 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333957  normal  0.0653539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3620  17 kDa surface antigen  42.53 
 
 
236 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  42.65 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  35.35 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  42.7 
 
 
269 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  55.81 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  36.5 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  38.84 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  38.84 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  34.88 
 
 
155 aa  52  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  37.62 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  37.61 
 
 
157 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  52.08 
 
 
179 aa  52  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  43.2 
 
 
250 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  30.77 
 
 
155 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  36.63 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  42.03 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  36.63 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  36.63 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  45.61 
 
 
294 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  32.5 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0885  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein precursor  43.55 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  41.46 
 
 
247 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  45.61 
 
 
280 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  36.94 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  30 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1639  17 kDa surface antigen  54 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  31.03 
 
 
160 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  39.02 
 
 
247 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  39.73 
 
 
208 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  30.33 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  48.15 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  48.15 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  48.15 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  33.72 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2648  17 kDa surface antigen  37.96 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  27.06 
 
 
257 aa  44.7  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  41.09 
 
 
243 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  44.66 
 
 
242 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  26.47 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  52.83 
 
 
274 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  40.35 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  39.44 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  30.1 
 
 
124 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  40 
 
 
157 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  40 
 
 
157 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  30.77 
 
 
163 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  40 
 
 
157 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1310  17 kDa surface antigen  43.12 
 
 
159 aa  42  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.13567 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04811  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  25.73 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  39.71 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  38.24 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>