104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1189 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  58.1 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  50.28 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  50.28 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  43.65 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  52.59 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  52.94 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  38.25 
 
 		 272 aa  97.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  39.25 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  39.25 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  38.53 
 
 		 216 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  39.51 
 
 		 204 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  38.43 
 
 		 216 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  42.57 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  42.57 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  42.57 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  42.57 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  42.57 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  42.57 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  39.33 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  42.57 
 
 		 218 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  40.1 
 
 		 206 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  43.36 
 
 		 217 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  58.33 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  42.75 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  47.66 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  43.56 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  45.79 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  37.23 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  43.59 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  40.71 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  55.17 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  47.22 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  63.41 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  36.72 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  60.98 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  42.4 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  32.79 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  39.82 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 269 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0072  17 kDa surface antigen  40.6 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00385  putative glycin-rich transmembrane protein  45.45 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  42.06 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  42.06 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  47.06 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  42.67 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  32.95 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  44.93 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0358  17 kDa surface antigen  31.68 
 
 		 124 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.649032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  35.33 
 
 		 247 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  38.95 
 
 		 247 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  44.62 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  35.66 
 
 		 294 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  59.57 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  30.19 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2648  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  59.57 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  59.57 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  43.08 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  43.08 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  43.08 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  44.79 
 
 		 247 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  59.57 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  37.97 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  37.84 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  43.36 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  30.09 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01571  hypothetical protein  41.18 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  70.37 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  30.63 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  42.71 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  42.11 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  70.37 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003952  outer membrane lipoprotein  37.25 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0034992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  55.32 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  41.25 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  38.66 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>