74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01571 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01571  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  316  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003952  outer membrane lipoprotein  85.43 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0034992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  48.08 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  48.15 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  43.31 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  45.81 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  44.16 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  44.9 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  44.16 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  43.51 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  43.14 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  48.53 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2223  17 kDa surface antigen  44.44 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000654513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1570  17 kDa surface antigen  45.03 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000417711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  43.14 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000185697  normal  0.0842318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  43.14 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000826442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1883  17 kDa surface antigen  43.14 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119533  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0595  hypothetical protein  47.14 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  41.79 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  41.79 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  41.79 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  41.79 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  41.79 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  40.3 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  31.78 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  31.78 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  48.94 
 
 		 257 aa  48.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  40.3 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  43.4 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  47.92 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  31.69 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  37.31 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  63.64 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  63.64 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  63.64 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  33.77 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  63.64 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  33.77 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  60.61 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  60.61 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  33.77 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  30.6 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  33.77 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  33.72 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  40.58 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  32.31 
 
 		 159 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  35.62 
 
 		 376 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  35.21 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  29.91 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  47.37 
 
 		 272 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  33.75 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  28.93 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  30.12 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  30.12 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  30.12 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  30.12 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  30.12 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  30.12 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  26.14 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6717  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  34.78 
 
 		 281 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  34.21 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  30.12 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>