87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3462 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  100 
 
 
259 aa  510  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  50.66 
 
 
225 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  37.08 
 
 
280 aa  89  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  43.12 
 
 
294 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  53.04 
 
 
192 aa  85.1  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  35.5 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  46.77 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  46.28 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  34.78 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  45.69 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  46.55 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  43.62 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  44.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  44.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  45.69 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  44.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  44.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  44.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  44.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  43.02 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  43.02 
 
 
218 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  43.18 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  43.18 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  43.18 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  43.18 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  40.91 
 
 
272 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  45.69 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  45.69 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  45.69 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  45.69 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  45.69 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  45.69 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  45.69 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  34.46 
 
 
165 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  34.46 
 
 
165 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  42.53 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  35.86 
 
 
208 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  36.07 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  36.59 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  36.07 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4766  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000649517  hitchhiker  0.00211864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  45.95 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  37.25 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  36.07 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  37.07 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  37.07 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  52  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  37.43 
 
 
241 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  32.79 
 
 
168 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  37.43 
 
 
241 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  39.44 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  36.71 
 
 
178 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  36.71 
 
 
175 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  35.17 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  46.99 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.59 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  37.88 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  38.26 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  58.14 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  35.71 
 
 
173 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  38.33 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  38.33 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  45.74 
 
 
164 aa  45.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  56.6 
 
 
179 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  38.32 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  37.14 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  48.78 
 
 
175 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  40.51 
 
 
179 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  40.51 
 
 
179 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  40.51 
 
 
179 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  26.54 
 
 
189 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  56.6 
 
 
179 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>