109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4766 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4766  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 232 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000649517  hitchhiker  0.00211864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  64.78 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  42.73 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  47.84 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  47.84 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  39.69 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  40.12 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  43.7 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  54.67 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  36.71 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  33.95 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  33.95 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  33.95 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  44.23 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  33.95 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  33.95 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  33.95 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  33.95 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  33.53 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  33.53 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  39.62 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  47.12 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  39.62 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  32.67 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  37.96 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  46.15 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  56.58 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  35.34 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  39.36 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  39.33 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  54 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  54 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  42.31 
 
 		 167 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  39.42 
 
 		 164 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  50.67 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  35 
 
 		 155 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 168 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  42.25 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  40.3 
 
 		 154 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  36.9 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  34.67 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  31.68 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  34.18 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  37.88 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  35.92 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  37.88 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  31.48 
 
 		 155 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  38.38 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  35.11 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  35.53 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  44.05 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  47.83 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  47.83 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  36.36 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  47.83 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  40.98 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  46.43 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  31.07 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  32.6 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  35.51 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  30.69 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  35.29 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  45.65 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  35.51 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  35.51 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  45.65 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 154 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  45.07 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  56.76 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  51.28 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  45.07 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  45.07 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  56.76 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  51.28 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1310  17 kDa surface antigen  38.94 
 
 		 159 aa  42.4  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  44.9 
 
 		 176 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  36.17 
 
 		 263 aa  42  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  54.76 
 
 		 241 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  54.76 
 
 		 241 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>