80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0175 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 274 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  54.01 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  45.14 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  44.75 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  46.35 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  44.51 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  35.88 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  41.46 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  41.46 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  41.75 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  51.7 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  40.78 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  40.78 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  40.78 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  40.78 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  40.78 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  40.78 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  35.29 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  39.81 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  50 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  34.1 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  48.21 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  39.49 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  41.67 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  39.62 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  38.22 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  46.49 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  33.05 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  36.89 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  48.18 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  30.22 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  36.89 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  36.89 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  36.89 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  36.89 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  35.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  48.18 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  39.63 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  40.7 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  42.96 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  42.96 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  33.96 
 
 		 175 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  34.65 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  41.86 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  34.65 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  43.93 
 
 		 168 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  49.56 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  34.32 
 
 		 185 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  33.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  33.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  45.56 
 
 		 163 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  46.81 
 
 		 167 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  34.72 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  44.44 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  32.16 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  39.61 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  44.59 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  49.32 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  39.29 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  51.06 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  37.14 
 
 		 155 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>