90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1033 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  48.25 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  48.25 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  46.84 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  45.61 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  45.61 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  39.17 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  39.09 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4766  17 kDa surface antigen  37.78 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000649517  hitchhiker  0.00211864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  38.26 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  36.23 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  34.55 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  34.55 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  42.24 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  42.24 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  34.78 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  55.26 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  33.18 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  34.6 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  38.67 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  38.67 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  38.67 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  38.67 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  38.67 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  38.67 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  38.67 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  47.66 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  35.21 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  42.57 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  54.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  54.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  54.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  54.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  54.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  39.05 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  54.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  54.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  52.05 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  52.05 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  38.79 
 
 		 280 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  52.05 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  52.05 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  49.06 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  50.68 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  50.68 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  35.96 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  44.59 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  37.9 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  50.67 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  37.7 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  40.24 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  34.56 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  39.58 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  39.58 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  37.62 
 
 		 168 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  32.47 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  42.48 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 166 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  36.63 
 
 		 163 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  43.75 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  32.32 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4947  17 kDa surface antigen  46.15 
 
 		 181 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0911907  normal  0.340805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  45.1 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  46.94 
 
 		 178 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  29.06 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  37.31 
 
 		 154 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  45.12 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  45.12 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  45.12 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  44 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  40.34 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  42 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  42 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  42 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  42 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  42 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_003296  RS00385  putative glycin-rich transmembrane protein  40.54 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  42 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  33.85 
 
 		 155 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  37.5 
 
 		 263 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>