101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2029 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  99.2 
 
 		 251 aa  483  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  86.45 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  86.45 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  85.26 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  86.45 
 
 		 242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  86.11 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  70.36 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  69.57 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  69.57 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  69.57 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  69.57 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  69.57 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  69.57 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  69.57 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  54.02 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  53.64 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  68.18 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  40.57 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  43.56 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  43.03 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  39.17 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  39.17 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  41.7 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  42 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  40.8 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  43.24 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  43.24 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  43.24 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  36.06 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  43.24 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  43.24 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  43.24 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  43.24 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  51.16 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  43.17 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  43.93 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  47.31 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  40 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  43.44 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  43.44 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  38.61 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  40.54 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  52.78 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  39.86 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  48.28 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  38.17 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  38.17 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4766  17 kDa surface antigen  36.58 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000649517  hitchhiker  0.00211864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  42.51 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  39.92 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  45.33 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  28.57 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  46.32 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  39.69 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  49.12 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  30.66 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  47.37 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  41.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  42.59 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  40.43 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  34 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  39.44 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  46.99 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  46.43 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  39.06 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  28.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  35.92 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  38.89 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  27.91 
 
 		 164 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  41.75 
 
 		 167 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  27.91 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  28.36 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  28.36 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  28.36 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  35.8 
 
 		 177 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  32.5 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  35.38 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  33.78 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1310  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 159 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 155 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  38.39 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  37.72 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  32.46 
 
 		 163 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  36.67 
 
 		 146 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2461  17 kDa surface antigen  30.99 
 
 		 156 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000826442  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2581  17 kDa surface antigen  30.99 
 
 		 156 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000185697  normal  0.0842318 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>