46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1377 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  100 
 
 
146 aa  283  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  47.3 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  52.73 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  54.76 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  54.76 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  54.76 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  54.76 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  54.76 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  54.76 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  54.76 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  54.76 
 
 
272 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  54.76 
 
 
208 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  54.76 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 
216 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  54.76 
 
 
206 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  44.59 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  44.59 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  37.35 
 
 
215 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  37.35 
 
 
215 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  36.08 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  34.19 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  35.07 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  54.55 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  54.55 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  54.55 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  54.55 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  54.55 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  40.54 
 
 
257 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  40.54 
 
 
257 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  54.55 
 
 
175 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  52.27 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  32.53 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  60 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  48.65 
 
 
177 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  35.44 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  27.59 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  35.07 
 
 
430 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  28.92 
 
 
182 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>