112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1451 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  100 
 
 
242 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  69.17 
 
 
241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  66.93 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  57.09 
 
 
242 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  55.28 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  55.28 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  53.66 
 
 
241 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  53.66 
 
 
241 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  53.66 
 
 
241 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  53.66 
 
 
241 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  53.66 
 
 
241 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  53.66 
 
 
241 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  53.66 
 
 
241 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  55.74 
 
 
240 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  45.1 
 
 
225 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  40.83 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  40.32 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  69.09 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  67.89 
 
 
251 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  66.97 
 
 
251 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  64.55 
 
 
246 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  42.02 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  42.02 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  49.25 
 
 
269 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  44.69 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  44.69 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  43.62 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  38.19 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  38.19 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  42.08 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  41.88 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  39.04 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  35.77 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  35.77 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  42.8 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  54.81 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  35.37 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  27.72 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  40.37 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  35.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  35.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  35.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  35.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  35.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  35.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  35.5 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  35.92 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  39.77 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  38.61 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  40.43 
 
 
164 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4766  17 kDa surface antigen  38.75 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000649517  hitchhiker  0.00211864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  41.38 
 
 
217 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  40.38 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  40.38 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  38.46 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  38.46 
 
 
179 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  38.46 
 
 
179 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  38.46 
 
 
179 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  38.46 
 
 
179 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  42.71 
 
 
186 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.94 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  54.9 
 
 
175 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5096  17 kDa surface antigen  39.73 
 
 
190 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254205  normal  0.114391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  38.19 
 
 
185 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  65.85 
 
 
178 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  39.64 
 
 
157 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  38.67 
 
 
166 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  50.88 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  50.88 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  37.14 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  38.57 
 
 
177 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  34.85 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  31.06 
 
 
156 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
156 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  40.54 
 
 
158 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
157 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  30.25 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  38.46 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  39.73 
 
 
158 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  39.36 
 
 
146 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  37.04 
 
 
160 aa  45.8  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  28.05 
 
 
992 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  33.06 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  33.85 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  46.51 
 
 
175 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  36.04 
 
 
157 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  36.04 
 
 
157 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  34.75 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  36.04 
 
 
157 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>