23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3641 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  48.04 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  38.2 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  39.53 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3958  hypothetical protein  46.94 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101039  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  42.22 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  39.33 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  42.62 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  54.39 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  54.39 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  46.94 
 
 		 132 aa  47.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  43.28 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  43.28 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  58.97 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  56.25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  52.94 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  52.94 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  52.94 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  49.02 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  50.77 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  46.55 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  46.55 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  49.23 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>