42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5975 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  100 
 
 		 92 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  67.5 
 
 		 81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  58.62 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6124  hypothetical protein  54.84 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  50.91 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  44 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  46.07 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  43.42 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  50.91 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  37.18 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  41.76 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  40.79 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  40.79 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  37 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  42.19 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  53.7 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  57.63 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  52.17 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  46.51 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  43.06 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3958  hypothetical protein  53.33 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101039  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  51.02 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  51.02 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  39.66 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  55.56 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  41.03 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  39.58 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  41.03 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  50 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  39.71 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  48.39 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  37.62 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  61.76 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  46.43 
 
 		 77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  46.43 
 
 		 77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  38.03 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  38.64 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  40.91 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>