55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4294 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  323  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  89.76 
 
 		 207 aa  271  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  68.9 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  68.9 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  52.27 
 
 		 196 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  45.3 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  49.6 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  49.6 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  49.12 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  46.38 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  47.37 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  38.06 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  54.05 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  44.95 
 
 		 113 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  47.83 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  47.83 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  42.37 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  55.56 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  52.44 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  44.16 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  47.47 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  47.37 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  43.48 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  41.38 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  40.71 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  40.71 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  46.43 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  48.11 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  40.62 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  39.33 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  51.67 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  39.33 
 
 		 83 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  40.17 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  45.95 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  47.22 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  47.14 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  43.04 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  52.17 
 
 		 92 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  52.17 
 
 		 92 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  47.14 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  55.56 
 
 		 81 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01668  signal peptide protein  50 
 
 		 62 aa  44.3  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  40.58 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  40.58 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  57.89 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  42.7 
 
 		 101 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4202  hypothetical protein  43.59 
 
 		 83 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  39.47 
 
 		 88 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3092  putative signal peptide protein  59.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3715  hypothetical protein  34.78 
 
 		 105 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  58.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>