22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6121 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  100 
 
 		 78 aa  153  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  52.56 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  52.56 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  49.37 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  48.24 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  61.7 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  40.26 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  46.97 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  44.58 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  57.45 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  50 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  42.5 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  37.84 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  37.84 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  54.35 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  47.46 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  51.16 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  54.35 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  48.98 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  43.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  45.9 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>