54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5572 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  217  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  60 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  52.22 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  41.94 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  58.46 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  39.78 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  75 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  75 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  43.59 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  71.74 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  41.57 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  53.85 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  52.24 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  52.24 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  66.67 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  40.78 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  57.89 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  55.17 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  54.9 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  55.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  55.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  57.38 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  50.72 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  69.77 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  57.45 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  51.92 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  51.92 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  46.15 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  54.24 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  40.32 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  58.33 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  58.33 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  65.71 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  38.2 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  58.97 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  61.36 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  61.36 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  39.13 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  58.7 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  48.39 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  40.43 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3958  hypothetical protein  53.06 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101039  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  45.9 
 
 		 101 aa  43.5  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  60.53 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  52.63 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  42.62 
 
 		 88 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  43.55 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  51.11 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  48.98 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  45.45 
 
 		 82 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>