39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3454 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  225  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  64.96 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  48.91 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  41.75 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  55.22 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  48.51 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  48.57 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  50 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  44.05 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  56.67 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  56.67 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  44.3 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  44.3 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  47 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  47 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  37.62 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  48.39 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  47.46 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  37.21 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  43.24 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  47.46 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  41.54 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  42.19 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  42 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  45 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  45 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3092  putative signal peptide protein  52.17 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  32.43 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  34.74 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  39.66 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  39.66 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  53.57 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  38.27 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  34.62 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  55.88 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  41.56 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  41.07 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  39.19 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  48.94 
 
 		 100 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>