33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3982 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  191  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  78.38 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  67.21 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  69.64 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  65.31 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  65.31 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  62.71 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  66.67 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  55.93 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  76.92 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  53.12 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4239  hypothetical protein  57.5 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  47.22 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  71.43 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  38.64 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  53.49 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  51.16 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  52.83 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  52.83 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  48.21 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  48.21 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5620  hypothetical protein  39.24 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  46.51 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  53.06 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  57.14 
 
 		 168 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  44 
 
 		 102 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  45.83 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  48.98 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  47.92 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  48.94 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  35.21 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>