53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4908 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  100 
 
 		 165 aa  321  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  99.39 
 
 		 165 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  69.51 
 
 		 168 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  68.29 
 
 		 207 aa  197  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  56.74 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  45.38 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  45.24 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  45.24 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  46.76 
 
 		 128 aa  87.8  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  49.14 
 
 		 123 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  46.55 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  43.1 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  43.1 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  47.69 
 
 		 114 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  43.64 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  54.32 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  54.67 
 
 		 85 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  52.27 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  37.8 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  43.59 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  44.79 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  44.19 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  46.85 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  52.44 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  48.15 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  51.22 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  48.57 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  69.44 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  69.44 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  41.76 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  55 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  42 
 
 		 115 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  49.28 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  37.74 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  37.74 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  42.03 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  36.59 
 
 		 94 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  46.75 
 
 		 127 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  43.53 
 
 		 81 aa  50.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  51.02 
 
 		 92 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  51.02 
 
 		 92 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  37.76 
 
 		 89 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  48.57 
 
 		 101 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  50.77 
 
 		 90 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  46.94 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  45 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  53.19 
 
 		 77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  53.19 
 
 		 77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  45.21 
 
 		 83 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  61.76 
 
 		 99 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>