22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4584 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  78.38 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  68 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  78.05 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  56.9 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  62.07 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  74.29 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  74.29 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  71.43 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  42.68 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  40.24 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4239  hypothetical protein  58.33 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  65.79 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  50.88 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5620  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  51.11 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  50 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  60 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  50 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  53.66 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>