51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5281 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  51.89 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  54.46 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  59.52 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  59.52 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  51.85 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  52.63 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  53.68 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  41.04 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  42.86 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  44.95 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  43.64 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  48.98 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  41.96 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  55.41 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  43.75 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  48.48 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  48.48 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  58.93 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  53.23 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  41.77 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  49.18 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  30.3 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  43.66 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  63.89 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  63.89 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  35.71 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  51.35 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  27.84 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  30.48 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  58.97 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4239  hypothetical protein  52.27 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  63.64 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  51.56 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  35.42 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  40.3 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  40.3 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  34.38 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  38.98 
 
 		 142 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  34.88 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  34.88 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  44.23 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5620  hypothetical protein  38.96 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01668  signal peptide protein  55.88 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3762  hypothetical protein  35.19 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  56.1 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>