39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1797 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  97.59 
 
 		 83 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  51.85 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  51.9 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  54.9 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  51.61 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  63.64 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  69.44 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  69.44 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  50.79 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  52.17 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  43.21 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  55.32 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  63.89 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  42.37 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  42.11 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  44.07 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  50 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  43.59 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  50 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  43.59 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  51.28 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  50.88 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  39.78 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  48.21 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  48.21 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  39.78 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  44.44 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  55.36 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01668  signal peptide protein  44.74 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  48.21 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  48.21 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  35.59 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  55.56 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  48.94 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  38.89 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  39.71 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  39.71 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>