49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3645 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  100 
 
 		 140 aa  272  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  100 
 
 		 140 aa  272  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  81.58 
 
 		 114 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  57.73 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  57.73 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  43.8 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  59.52 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  62.77 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  62.77 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  49.6 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  56.76 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  47.45 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  51.64 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  43.42 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  50 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  48.33 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  53 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  46.03 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  45.67 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  73.17 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  74.29 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  52.94 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  55.36 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  48.24 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  41.56 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  56.16 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  58.18 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  54.79 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  38.96 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  52.63 
 
 		 85 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  37.17 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  47.44 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  47.44 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  48.21 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  39.44 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  48.21 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3715  hypothetical protein  37.11 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  57.41 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  29.69 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  52.94 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  44.07 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3092  putative signal peptide protein  58.54 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  34.58 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4239  hypothetical protein  75 
 
 		 125 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  56.25 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  34.12 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  52 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  52 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  38.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>