18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4461 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  100 
 
 		 88 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  42.53 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  43.82 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  36.73 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  45 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  49.25 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  45.61 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  45 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  45.98 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  49.25 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  49.25 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  42.62 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4264  hypothetical protein  38.96 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  45.07 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  38.71 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  38.71 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  38.37 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  38.71 
 
 		 114 aa  40  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>