36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4187 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  100 
 
 		 165 aa  327  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  59.76 
 
 		 165 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  59.76 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  47.37 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  51.23 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  39.55 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  50.94 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  43.37 
 
 		 95 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  47.89 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  34.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  34.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  48.28 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  48.28 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  34.58 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  46.34 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  34.58 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  31.85 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  46.15 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  44.78 
 
 		 85 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  30.48 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  40.58 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  37.35 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  56.25 
 
 		 90 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  30.99 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  31.06 
 
 		 112 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  32.1 
 
 		 106 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  43.9 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  39.13 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  36.05 
 
 		 94 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  36.05 
 
 		 94 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  35.16 
 
 		 90 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>