30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6143 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  100 
 
 		 81 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  75.47 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  75.47 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  44.94 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  46.38 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  42.22 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  46.48 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6124  hypothetical protein  46.88 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.382149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  53.85 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  42.5 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  36.9 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  50 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  53.33 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  52.17 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  45.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  55.56 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  50 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  52.08 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  52.08 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  52.17 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  54.9 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  41.79 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  51.85 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  44.68 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  44.68 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  43.4 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3958  hypothetical protein  52.5 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  42.31 
 
 		 112 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>