32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0477 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  159  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  58.33 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  45.12 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  52.05 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  61.54 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  50.77 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  46.59 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  46.84 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  51.67 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  47.37 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  47.37 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  42.22 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  57.45 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  57.45 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  46.99 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  45.31 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  49.15 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  38.27 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  49.15 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  63.89 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  42.65 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  46.97 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  45 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  45 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  40.96 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  41.54 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  41.67 
 
 		 196 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>