19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1788 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  55.1 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  47.83 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  39.47 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  43.84 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  45 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  51.16 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  34.57 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  34.57 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  41.79 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  54.29 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  56.25 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  61.76 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  61.76 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  37.8 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  54.05 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  55.56 
 
 
123 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>