22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5765 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  51.81 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  60.98 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  60.98 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  57.89 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  40.48 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  55.81 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  55.81 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  46.58 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  58.82 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  52.63 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  55.81 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  59.46 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  39.76 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  55 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  39.76 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  35.9 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  51.85 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  59.38 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>