43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5383 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  71.43 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  53.85 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  50.63 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  50.63 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  47.5 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  53.45 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  45.95 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  56.52 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  68.42 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  59.62 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  59.62 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  60.98 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 85 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  53.23 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  47.06 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  50.7 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  57.45 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  51.61 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  50.79 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  61.36 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  50.94 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  37.66 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  46.05 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  40.58 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  41.38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  52.94 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  49.12 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  44.62 
 
 		 140 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  44.62 
 
 		 140 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  61.11 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  61.11 
 
 		 153 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  55.56 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  46.43 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  46.43 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  40.54 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  55.56 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  50.98 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>