28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5453 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  58.46 
 
 
81 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  48.24 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  39.53 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  39.47 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  50.98 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  50.98 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  49.02 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  53.85 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  57.89 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  38.82 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  51.56 
 
 
85 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  55.26 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  52 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  52 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  48.39 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  40 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  40.23 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  45.9 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  47.37 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  34.12 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  34.12 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  37.35 
 
 
165 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  38.55 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  44.74 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  44.74 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>