43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2377 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  100 
 
 		 90 aa  176  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  97.78 
 
 		 90 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  62.22 
 
 		 80 aa  87.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  48.15 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  47.75 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  52 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  47.06 
 
 		 168 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  55.38 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  55.38 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  47.22 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  52.44 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  52.44 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  68.52 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  41.13 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  41.13 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  44.9 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  47.62 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  50 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  43.59 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  59.38 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  36.44 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  44.59 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  54.1 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  44.44 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  44.74 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  37.23 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  50 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  46.55 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  39.76 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  51.79 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  39.77 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4264  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  52.94 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  47.62 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  52.94 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  34.69 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  50.75 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  68.75 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  31.46 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  32.58 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>