31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4328 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  59.09 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  50.3 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  45.38 
 
 		 165 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  45.38 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  38.29 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  45 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  62 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  43.18 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  55 
 
 		 85 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  36.08 
 
 		 90 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  28.48 
 
 		 128 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  40.32 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  35.05 
 
 		 90 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  29.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  29.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  45.16 
 
 		 80 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  38.14 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  31.13 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  30.7 
 
 		 114 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  38.82 
 
 		 89 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 112 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  31.52 
 
 		 120 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  31.52 
 
 		 120 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  36.9 
 
 		 115 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  44.07 
 
 		 95 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  35.59 
 
 		 83 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  32.56 
 
 		 106 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  35.59 
 
 		 83 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  41.56 
 
 		 105 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>