46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4292 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  89.76 
 
 		 168 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  67.68 
 
 		 165 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  67.68 
 
 		 165 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  59.09 
 
 		 196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  47.37 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  39.24 
 
 		 132 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  48.25 
 
 		 132 aa  85.1  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  43.42 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  43.42 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  46.96 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  51.49 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  43.22 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  43.22 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  41.96 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  48.86 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  42.02 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  42.24 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  51.22 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  48.24 
 
 		 85 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  38.89 
 
 		 112 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  42.98 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  38.16 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  44.9 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  41.3 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  46.9 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  48.6 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  44.68 
 
 		 90 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  42.35 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  51.67 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  37.78 
 
 		 83 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  52.17 
 
 		 83 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  42.57 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  47.14 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  40.91 
 
 		 94 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  39.25 
 
 		 115 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  42.42 
 
 		 94 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  48.98 
 
 		 92 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  48.98 
 
 		 92 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  51.61 
 
 		 77 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  51.61 
 
 		 77 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  61.76 
 
 		 99 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  52.17 
 
 		 81 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>