14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4923 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  260  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  39.24 
 
 		 207 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  38.06 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  44.9 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  46.74 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  37.8 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  47.3 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  37.93 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  43.18 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  39.19 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  41.54 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  39.47 
 
 		 95 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 123 aa  40.8  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>