33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1797 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  53.33 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  48.53 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  54.1 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  43.42 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  54.1 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  46.88 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  45.57 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  44 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  68.42 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  68.42 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  55.32 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  53.19 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  41.67 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  63.16 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  51.67 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  58.97 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  51.67 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  46.97 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  36.47 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  57.89 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  45.16 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  49.06 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  55.81 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  39.19 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  57.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  43.33 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  42.11 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  54.05 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  53.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  53.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  42.59 
 
 		 100 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  61.11 
 
 		 80 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>