50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2240 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  100 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  60 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  54.67 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  54.67 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  57.75 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  53.33 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  52.94 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  52.94 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  46.99 
 
 		 90 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  51.39 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  60.71 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  49.28 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  42.7 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  47.83 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  52.94 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  37.61 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  53.97 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  48.28 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  42.72 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  41.89 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  52.46 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  41.77 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  50.91 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  50.91 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  44.05 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  52.38 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  55.93 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  44.78 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  52.63 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  52.63 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  58 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  58 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  37.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  38.67 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  56.14 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  51.56 
 
 		 83 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  33.98 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  63.16 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  39.08 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  58.33 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  63.16 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  36.78 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  45.76 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3958  hypothetical protein  52.54 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  39.73 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  36.49 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  38.82 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01668  signal peptide protein  51.52 
 
 		 62 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>