12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01668 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01668  signal peptide protein  100 
 
 		 62 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  33.82 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  44.74 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  54.29 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  55.88 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  55.88 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  51.52 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  46.51 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  46.51 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  55.88 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  54.55 
 
 		 109 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>