51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1291 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  100 
 
 		 128 aa  245  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  80 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  52.53 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  51.52 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  51.49 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  50 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  50 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  62.16 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  48.62 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  49.17 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  48.94 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  74.47 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  58.57 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  57.75 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  55.7 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  55.7 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  58.73 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3715  hypothetical protein  45.71 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  45.83 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  54.29 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  53.26 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  63.64 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  63.64 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  39.06 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  48.94 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  48.94 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  53.33 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  59.38 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  57.81 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  52.38 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  51.16 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  54.72 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  42.19 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  42.19 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  30.61 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  29.01 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  64.71 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  71.43 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  61.9 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  61.11 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  61.11 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  61.36 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  61.36 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  57.5 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3092  putative signal peptide protein  47.5 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6143  metal resistance protein  50 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  44.29 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  60 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>