34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0491 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  253  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  99.22 
 
 		 129 aa  253  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  73.98 
 
 		 115 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  51.56 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  51.56 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  50.86 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  53.68 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  61.67 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  50 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  71.15 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  44.35 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  43.8 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  38.93 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  43.48 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  40.71 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  44.9 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  44.9 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  37.21 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  43.08 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  40.57 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  45 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  39.08 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  37.93 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  41.98 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  30.91 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  33.04 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  35.62 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  35.62 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4239  hypothetical protein  66.67 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  37.29 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  30 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  41.77 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>