29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3026 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  100 
 
 		 94 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  94.68 
 
 		 94 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3092  putative signal peptide protein  80.85 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  50.7 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  42.65 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  57.5 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  52.17 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  39.06 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  46.94 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6393  putative signal peptide protein  38.36 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241521  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  40.48 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  38.96 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  38.96 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  52.27 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  44.07 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  44.07 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  51.35 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  29.89 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  47.73 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  41.38 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  41.38 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  32.98 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  40.43 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  43.9 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  43.9 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  57.14 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  47.37 
 
 		 99 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  36.54 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>