20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3092 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3092  putative signal peptide protein  100 
 
 		 92 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  81.91 
 
 		 94 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  80.85 
 
 		 94 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6393  putative signal peptide protein  43.06 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0241521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  36.11 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  35.8 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  52.17 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  44.16 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  44.16 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  40.91 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  53.12 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  44.07 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  44.07 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  41.3 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  41.3 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  59.38 
 
 		 168 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  40.98 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  38.03 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  53.12 
 
 		 123 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>