50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4032 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  100 
 
 		 123 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  54.74 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  57.14 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  57.14 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  49.14 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  49.14 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  49.17 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  52.99 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  46.96 
 
 		 207 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  47.37 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  48.41 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  47.83 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  48.45 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  48.45 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  46.83 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  52.38 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  41.12 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  42.68 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  41.84 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  46.22 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  45.53 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  46.23 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  44 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  43.82 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  42.67 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  55.56 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  37.61 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  48.53 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  44.44 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4187  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ-like protein  33.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.623428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1630  hypothetical protein  53.19 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  42.59 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  43.33 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  31.19 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  39.71 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  39.71 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  35.51 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  59.46 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  49.15 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  33.64 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  40.54 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  81.82 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  81.82 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  40.54 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  55.56 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  35.05 
 
 		 245 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3092  putative signal peptide protein  53.12 
 
 		 92 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>