32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1699 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  51.9 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  51.9 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  46.97 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  47.44 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  47.44 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  37.84 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  46.84 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  55 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  54.17 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  55 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  48.28 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  61.11 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  46.15 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  46.15 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  65.62 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  40.58 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  44.59 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  45.83 
 
 		 115 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5765  hypothetical protein  51.22 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  47.06 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  81.82 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  45.45 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  39.71 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  50.98 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>