37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0586 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  227  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  73.98 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  73.98 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  43.8 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  43.8 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  42.48 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  45.76 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  50.47 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  47.83 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  81.08 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  44.33 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  44.33 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  53.26 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4584  hypothetical protein  70 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  45.1 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  42 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  42 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  45.74 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  37.93 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  38.84 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  36.44 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3454  hypothetical protein  46.05 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4239  hypothetical protein  56.82 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153784  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3373  putative signal peptide protein  29.57 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3762  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3026  putative signal peptide protein  32.98 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  50.94 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3297  hypothetical protein  46.88 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  36.17 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  38.89 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  45.83 
 
 		 82 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  45.83 
 
 		 82 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  47.06 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  43.55 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  32.43 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>