13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3298 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  93.14 
 
 		 102 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  47.45 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  46.72 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  54.84 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4228  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4338  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.151127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  47.54 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  37.63 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  37.63 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  35.63 
 
 		 129 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  43.1 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3982  hypothetical protein  44 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>