30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1813 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  49.37 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3641  hypothetical protein  38.2 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  55.17 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  45.76 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1788  hypothetical protein  42.25 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  52.54 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  55.32 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  65.71 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  41.76 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  41.18 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  38.82 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  35.05 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  44.07 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  44.07 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  46.58 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  55.26 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  47.14 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  48.39 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  50 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  45.9 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5975  heavy metal resistance protein CzcJ  46.77 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1757  hypothetical protein  46.77 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683801  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  44.26 
 
 		 90 aa  42  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  46.97 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  32.43 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  45.45 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>