27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00368 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  100 
 
 		 101 aa  198  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  37.37 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  53.23 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  53.23 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  49.21 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  56.14 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  44.83 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  44.83 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  44.44 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  44.44 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  46.03 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  36.44 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  47.89 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  47.89 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1782  hypothetical protein  57.78 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.770369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  41.57 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  33.87 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  41.94 
 
 		 105 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  40.7 
 
 		 128 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  40.7 
 
 		 83 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  39.56 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  40.7 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  46.97 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  45.24 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>