28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4071 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  55.56 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  39.66 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  41.38 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6121  Cu(II)/Cu(I) resistance protein  43.9 
 
 		 78 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1638  putative signal peptide protein  46.34 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  69.77 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  56.52 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  56.52 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  47.37 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  47.37 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2918  putative signal peptide protein  44.44 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4461  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ-like protein  60.87 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108165  normal  0.0793697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4328  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.774388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  61.9 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  38.37 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  53.19 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4923  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  36.11 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  38.37 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  63.16 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5453  hypothetical protein  38.37 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3909  hypothetical protein  39.47 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0477  hypothetical protein  60.61 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1813  hypothetical protein  52.38 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.400735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  48.94 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  48.94 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  64.71 
 
 		 112 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>