40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0177 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  296  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.967448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0183  hypothetical protein  94.77 
 
 		 153 aa  280  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.888623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0320  hypothetical protein  58 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3622  hypothetical protein  47.45 
 
 		 102 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3298  hypothetical protein  45.99 
 
 		 102 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4338  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.151127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4228  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3645  putative signal peptide protein  46.03 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4722  conserved hypothetical signal peptide protein  46.03 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0508689 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4538  putative signal peptide protein  48.35 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88188  hitchhiker  0.00966889 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4405  conserved hypothetical signal peptide protein  48.35 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.811612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5594  hypothetical protein  49.07 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.609914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00831  putative signal peptide protein  43.9 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4908  metal response CopQ/CzcJ/MmrQ/MmtQ/MmmQ-like protein  48.15 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346044  decreased coverage  0.0003809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2377  putative signal peptide protein  50.56 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2782  conserved hypothetical signal peptide protein  49.44 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4292  hypothetical protein  48.6 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4294  hypothetical protein  48.11 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00636245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4032  putative signal peptide protein  53.26 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5281  hypothetical protein  49.41 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0504  hypothetical protein  38.93 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0960522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0586  hypothetical protein  37.93 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0491  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1291  putative signal peptide protein  51.16 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1183  putative signal peptide protein  53.33 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000008419  normal  0.847266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3571  hypothetical protein  48.57 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1797  hypothetical protein  39.78 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5572  hypothetical protein  61.36 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.168259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2121  hypothetical protein  39.05 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2240  putative signal peptide protein  62.79 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2514  putative signal peptide protein  70 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.0022772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1797  hypothetical protein  51.67 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00580661  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4071  hypothetical protein  53.19 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3414  hypothetical protein  43.96 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.763694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4264  hypothetical protein  37 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5383  hypothetical protein  61.11 
 
 		 77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1844  hypothetical protein  61.11 
 
 		 77 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838895  hitchhiker  0.000000147038 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5311  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1699  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00368  putative signal peptide protein  35.23 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>